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PyenvはPythonのバージョンを簡易に変更することができるソフトウェアです。 % Python global 3.X.X 上記コマンドでPythonのバージョンを変更できますが、実際に確認してみると % python -V>> 2.X.X 指定したバージョンとは違うバージョンが表示され...

Pyenvは有名なPythonのVersionを切り替えるためのソフトウェアです。MacOS Catalina以前の環境(bash shell）で使用していましたが、アップデートに伴い環境設定を再度行う必要がありましたので、まとめ直しました。 使用環境：MacOS Monterey Intel Core i...

探索的データ解析とは 予め仮説を立てた上でデータを収集し、解析を行うことは非常に重要です。事前に仮説を設定し、得られたデータセットを用いて仮説を検証することを仮説検証的研究と言います。一方で、得られたデータセットから新たに仮説を見出そうと...

Tree-based modelの中でも性能が高いと評判のLightGBMですが、pyenv/venvを用いた仮想環境からpipでインストールしようとするとErrorが出てしまったのでその解決法について調べた内容を記載します。 LightGBMインストール (libomp) 何も考えずにpipでLight...

MRIなどの脳画像をNifti formatで直接Pythonで読み込む際、便利なパッケージがあったため紹介します。NiBabelはマサチューセッツ工科大学で開発され、NIfTI format を含めた複数の脳画像形式に対応しています。本ページでは NIfTI format を読み込む方法を...

Pythonでライブラリをインストールする際、そのまま pip XXと導入するとライブラリの管理が煩雑になったり、ライブラリ同士が干渉したりする恐れがあります。そのため仮想環境を作成し、プロジェクトごとに必要なライブラリをインストールして使用します。...

Pythonの導入はありとあらゆるサイトで説明がありますが、新規のMacOSにPython環境構築をし直す機会があったため、できるだけシンプルに導入する方法を記載します。 2020.12.2 現在の最新versionは Python ver 3.9.0ですが、機械学習ライブラリを使用する...

医療など説明性が求められる分野においては、機械学習・分類モデルにおける特徴量の重要度評価についての検討が必要と思います。また、医学論文のStudyではデータに対して複数のモデルを作成し、比較する手法を取ることが多いです。本ページでは "scikit-l...